R à l’Usage des Sciences Sociales - Paris - 11 juin 2021

Recherche reproductible

Reproductibilité, réplicabilité

Selon Claerbout, Donoho, Peng (… et Giraud) :

Recherche reproductible : Les auteurs fournissent les données et le code nécessaire pour rejouer les analyses et recréer les résultats numériques.

Replication : Une étude arrive aux même résultats scientifiques en collectant de nouvelles données (éventuellement avec des méthodes différentes) et en réalisant une nouvelle analyse.


Attention, d’autres auteurs et institutions inversent ces définitons, les utilisent de manière indifférenciée ou rajoute le concept de répétabilité.

Barba, L. A. (2018). Terminologies for reproducible research. arXiv preprint arXiv:1802.03311.

Le spectre de la reproductibilité

Panorama des solutions assurant la reproductibilité des analyses avec R

La figure seule

La figure avec les données

.
├── data
│   ├── martinique.gpkg
│   └── rev.csv
└── fig
    └── map.png

La figure avec les données et les métadonnées

.
├── data
│   ├── martinique.gpkg
│   └── rev.csv
├── fig
│   └── map.png
└── metadata
    └── metadata.txt

La figure, les données, les métadonnées et le script

.
├── analyse
│   └── carte_revenus.R
├── data
│   ├── martinique.gpkg
│   └── rev.csv
├── fig
│   └── map.png
└── metadata
    └── medata.txt

La figure, les données, les métadonnées et le script

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